causp sword

%23%20%2F%2F%2F%20script%0A%23%20requires-python%20%3D%20%22%3E%3D3.11%22%0A%23%20dependencies%20%3D%20%5B%22marimo%3E%3D0.23.3%22%2C%20%22mcp%3D%3D2.0.0%22%2C%20%22numpy%3D%3D2.4.3%22%2C%20%22pandas%3D%3D3.0.2%22%2C%20%22plotly%3D%3D6.7.0%22%2C%20%22pyarrow%3D%3D22.0.0%22%5D%0A%23%20%0A%23%20%5Btool.marimo.export%5D%0A%23%20lock_kind%20%3D%20%22observed%22%0A%23%20%2F%2F%2F%0A%0Aimport%20marimo%0A%0A__generated_with%20%3D%20%220.25.2%22%0Aapp%20%3D%20marimo.App(%0A%20%20%20%20width%3D%22full%22%2C%0A%20%20%20%20layout_file%3D%22data%3Aapplication%2Fjson%3Bbase64%2CeyJ0eXBlIjogInNsaWRlcyIsICJkYXRhIjogeyJjZWxscyI6IFt7InR5cGUiOiAic2tpcCJ9LCB7fSwge30sIHt9LCB7fSwge30sIHt9LCB7fSwgeyJ0eXBlIjogImZyYWdtZW50In0sIHt9LCB7fSwgeyJ0eXBlIjogInNraXAifSwge30sIHt9LCB7fSwge30sIHt9LCB7InR5cGUiOiAiZnJhZ21lbnQifSwge30sIHt9LCB7fSwgeyJ0eXBlIjogImZyYWdtZW50In0sIHt9LCB7fSwgeyJ0eXBlIjogImZyYWdtZW50In0sIHt9LCB7InR5cGUiOiAiZnJhZ21lbnQifSwge30sIHt9LCB7fSwge30sIHt9LCB7fSwge30sIHt9XSwgImRlY2siOiB7fX19%22%2C%0A%20%20%20%20css_file%3D%22css%2Fcustom_sword.css%22%2C%0A%20%20%20%20html_head_file%3D%22%22%2C%0A%20%20%20%20auto_download%3D%5B%22html%22%5D%2C%0A)%0A%0A%0A%40app.cell%0Adef%20_()%3A%0A%20%20%20%20import%20marimo%20as%20mo%0A%0A%20%20%20%20return%20(mo%2C)%0A%0A%0A%40app.cell(hide_code%3DTrue)%0Adef%20_(mo)%3A%0A%20%20%20%20import%20re%0A%20%20%20%20import%20sys%0A%0A%20%20%20%20_RAW%20%3D%20%22https%3A%2F%2Fraw.githubusercontent.com%2FmustafaslanCoto%2Fmarimo-outputs%2Fmain%2Fapps%2Fhtml%22%0A%0A%20%20%20%20if%20sys.platform%20%3D%3D%20%22emscripten%22%3A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20from%20pyodide.http%20import%20open_url%0A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20_html%20%3D%20open_url(f%22%7B_RAW%7D%2Ftitle-sword.html%22).read()%0A%20%20%20%20else%3A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20import%20urllib.request%0A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20_html%20%3D%20urllib.request.urlopen(f%22%7B_RAW%7D%2Ftitle-sword.html%22).read().decode(%22utf-8%22)%20%23%20for%20local%20testing%0A%0A%20%20%20%20_src%20%3D%20lambda%20m%3A%20f'src%3D%22%7B_RAW%7D%2F%7Bm.group(1)%7D%22'%0A%0A%20%20%20%20%23%20drop%20Quarto's%20%60%60%60%7B%3Dhtml%7D%20fences%3B%20logos%20live%20in%20talks%2Fimages%0A%20%20%20%20_html%20%3D%20re.sub(r%22%5E%60%60%60.*%24%22%2C%20%22%22%2C%20_html%2C%20flags%3Dre.M)%0A%20%20%20%20_html%20%3D%20re.sub(r'src%3D%22(images%2F%5B%5E%22%5D%2B)%22'%2C%20_src%2C%20_html)%0A%20%20%20%20%23%20scale%20with%20the%20slide%20width%20(Quarto%20reveal%20does%20this%20via%20its%201920x1080%20canvas)%0A%20%20%20%20_scale%20%3D%20%22%22%22%3Cstyle%3E%0A%20%20%20%20%20%20.ts-wrap%20%7B%20container-type%3A%20inline-size%3B%20width%3A%20100%25%3B%20overflow%3A%20hidden%3B%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20.ts-wrap%20.title-slide-custom%20%7B%20font-size%3A%202.1cqw%3B%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20.ts-wrap%20.title-slide-custom%20.logo-bar%20%7B%20margin-bottom%3A%204cqw%3B%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20.ts-wrap%20.title-slide-custom%20.logo-bar%20img%20%7B%20height%3A%206cqw%20!important%3B%20width%3A%20auto%20!important%3B%20max-width%3A%20none%3B%20%7D%0A%20%20%20%20%3C%2Fstyle%3E%22%22%22%0A%20%20%20%20mo.Html(f'%7B_scale%7D%3Cdiv%20class%3D%22ts-wrap%22%3E%7B_html%7D%3C%2Fdiv%3E')%0A%20%20%20%20return%20(re%2C)%0A%0A%0A%40app.cell(hide_code%3DTrue)%0Adef%20_(mo)%3A%0A%20%20%20%20_items%20%3D%20%5B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%22The%20Challenge%3A%20Why%20Patients%20Arrive%20and%20Why%20Some%20Stay%20Longer%3F%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%22Why%20is%20It%20So%20Important%3F%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%23%20%22Grouping%20diagnosis%20with%20Healthcare%20Resource%20Groups%20(HRGs)%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%22Methodology%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%22Key%20Results%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%22Next%22%0A%20%20%20%20%5D%0A%0A%20%20%20%20def%20outline(active%3DNone)%3A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20def%20_color(i)%3A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20if%20active%20is%20None%3A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20return%20%22%23999999%22%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20return%20%22%2320808D%22%20if%20i%20%3D%3D%20active%20else%20%22%23999999%22%0A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20_li%20%3D%20%22%22.join(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20f'%3Cli%20style%3D%22color%3A%7B_color(i)%7D%3Bfont-size%3A1em%3Bline-height%3A1.9%22%3E%7Bt%7D%3C%2Fli%3E'%20%23%20points%20%2B%20bullet%20size%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20for%20i%2C%20t%20in%20enumerate(_items)%0A%20%20%20%20%20%20%20%20)%0A%20%20%20%20%20%20%20%20return%20mo.Html(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20'%3Cstyle%3E.ol-list%20li%3A%3Amarker%20%7B%20font-size%3A%201.2em%3B%20%7D%3C%2Fstyle%3E'%20%20%20%23%20bullet%20dot%20only%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20'%3Cdiv%20style%3D%22container-type%3Ainline-size%3Bwidth%3A100%25%22%3E'%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20'%3Cdiv%20style%3D%22font-size%3A3cqw%3Bpadding%3A2cqw%204cqw%22%3E'%20%23%20master%20size%20(everything)%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20'%3Ch2%20style%3D%22font-size%3A1.6em%3Bfont-weight%3A700%3Bcolor%3A%23091717%3Bmargin%3A0%200%200.6em%200%22%3EOutline%3C%2Fh2%3E'%20%20%23%20title%20only%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20f'%3Cul%20class%3D%22ol-list%22%20style%3D%22font-weight%3A700%3Bmargin%3A0%3B'%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20f'padding-left%3A1.2em%3Blist-style%3Adisc%22%3E%7B_li%7D%3C%2Ful%3E'%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20'%3C%2Fdiv%3E%3C%2Fdiv%3E'%0A%20%20%20%20%20%20%20%20)%0A%0A%20%20%20%20return%20(outline%2C)%0A%0A%0A%40app.cell(hide_code%3DTrue)%0Adef%20_(outline)%3A%0A%20%20%20%20outline()%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell(hide_code%3DTrue)%0Adef%20_(outline)%3A%0A%20%20%20%20outline(0)%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell(hide_code%3DTrue)%0Adef%20_(mo%2C%20re)%3A%0A%20%20%20%20def%20fragment_md(markdown)%3A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20markdown%20%3D%20re.sub(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20r%22(%3Fm)%5E-%20(.%2B)%24%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20lambda%20match%3A%20f'%3Cspan%20class%3D%22fragment%22%3E%E2%80%A2%20%7Bmatch.group(1)%7D%3C%2Fspan%3E'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20markdown%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20)%0A%20%20%20%20%20%20%20%20return%20mo.md(markdown)%0A%0A%20%20%20%20_image%20%3D%20mo.Html(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'%3Cimg%20'%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'src%3D%22https%3A%2F%2Fraw.githubusercontent.com%2FmustafaslanCoto%2FmustafaslanCoto.github.io%2Fmain%2Ftalks%2Fimages%2Fhospital_bed.jpg%22%20'%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'alt%3D%22Hospital%20bed%22%20'%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'style%3D%22display%3Ablock%3Bwidth%3A100%25%3Bheight%3A600px%3Bobject-position%3Acenter%3Bborder-radius%3A8px%22%3E'%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%23%20'style%3D%22display%3Ablock%3Bwidth%3A100%25%3Bheight%3Aauto%3Bmax-height%3A65vh%3Bborder-radius%3A8px%22%3E'%0A%20%20%20%20)%0A%20%20%20%20_text%20%3D%20fragment_md(%22%22%22%0A%0A%20%20%20%20%23%23%20Problem%0A%0A%20%20%20%20-%20**Hidden%20Clinical%20Drivers%3A**%20The%20true%2C%20isolated%20impact%20of%20specific%20diagnoses%20on%20Length%20of%20Stay%20(LoS)%20remains%20unknown%0A%0A%20%20%20%20-%20**Tangled%20Hospital%20Data%3A**%20Hospitals%20need%20to%20understand%20why%20some%20patients%20stay%20longer%20than%20expected%2C%20but%20raw%20records%20mix%20together%20clinical%20diagnoses%2C%20patient%20age%2C%20chronic%20illnesses%2C%20and%20ward%20congestion.%0A%0A%20%20%20%20-%20**Correlations%20vs.%20Causes%3A**%20Standard%20machine%20learning%20predicts%20correlations%2C%20not%20causes%3A%20it%20cannot%20tell%20whether%20a%20diagnosis%20actively%20causes%20a%20delay%20or%20simply%20reflects%20why%20a%20patient%20arrived%20at%20the%20hospital%20in%20the%20first%20place.%0A%0A%20%20%20%20-%20**Reclaiming%20Bed%20Capacity%3A**%20Identifying%20clear%2C%20diagnosis-specific%20discharge%20protocols%20early%20in%20admission%20is%20essential%20to%20taking%20proactive%20action%2C%20preventing%20avoidable%20delays%2C%20and%20freeing%20up%20acute%20hospital%20beds.%0A%0A%20%20%20%20%22%22%22)%0A%0A%20%20%20%20%23%20_text%20%3D%20mo.md(%22%22%22%0A%20%20%20%20%23%20%23%23%20Why%20does%20it%20matter%3F%0A%0A%20%20%20%20%23%20%3Cul%3E%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%3Cli%20class%3D%22fragment%22%3E%3Cstrong%3EHidden%20Clinical%20Drivers%3A%3C%2Fstrong%3E%20The%20true%2C%20isolated%20impact%20of%20specific%20diagnoses%20on%20Length%20of%20Stay%20(LoS)%20remains%20unknown.%3C%2Fli%3E%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%3Cli%20class%3D%22fragment%22%3E%3Cstrong%3ETangled%20Hospital%20Data%3A%3C%2Fstrong%3E%20Hospitals%20need%20to%20understand%20why%20some%20patients%20stay%20longer%20than%20expected%2C%20but%20raw%20records%20mix%20together%20clinical%20diagnoses%2C%20patient%20age%2C%20chronic%20illnesses%2C%20and%20ward%20congestion.%3C%2Fli%3E%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%3Cli%20class%3D%22fragment%22%3E%3Cstrong%3ECorrelations%20vs.%20Causes%3A%3C%2Fstrong%3E%20Standard%20machine%20learning%20predicts%20correlations%2C%20not%20causes%3A%20it%20cannot%20tell%20whether%20a%20diagnosis%20actively%20causes%20a%20delay%20or%20simply%20reflects%20why%20a%20patient%20arrived%20at%20the%20hospital%20in%20the%20first%20place.%3C%2Fli%3E%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%3Cli%20class%3D%22fragment%22%3E%3Cstrong%3EReclaiming%20Bed%20Capacity%3A%3C%2Fstrong%3E%20Identifying%20clear%2C%20diagnosis-specific%20discharge%20protocols%20early%20in%20admission%20is%20essential%20to%20taking%20proactive%20action%2C%20preventing%20avoidable%20delays%2C%20and%20freeing%20up%20acute%20hospital%20beds.%3C%2Fli%3E%0A%20%20%20%20%23%20%3C%2Ful%3E%0A%20%20%20%20%23%20%22%22%22)%0A%20%20%20%20mo.hstack(%5B_image%2C%20_text%5D%2C%20widths%3D%5B0.45%2C%200.55%5D%2C%20align%3D%22center%22%2C%20gap%3D1)%0A%20%20%20%20return%20(fragment_md%2C)%0A%0A%0A%40app.cell%0Adef%20_(outline)%3A%0A%20%20%20%20outline(1)%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell(hide_code%3DTrue)%0Adef%20_(mo)%3A%0A%20%20%20%20mo.md(r%22%22%22%0A%20%20%20%20%23%23%20Advancing%20NHS%20Wales%20*Six%20Goals*%20for%20Urgent%20Care%0A%0A%20%20%20%20-%20**Goal%204%20(Rapid%20Assessment%20%26%20Cohorting)%3A**%20Frontloading%20diagnostic%20clarification%20during%20the%20critical%20first%2048%20hours%20of%20admission.%0A%20%20%20%20-%20**Goal%205%20(Optimal%20Hospital%20Care%20%26%20Timely%20Discharge)%3A**%20Activating%20diagnosis-tailored%20discharge%20readiness%20protocols%20before%20discharge.%0A%20%20%20%20-%20**Goal%206%20(Home%20First%20%2F%20Step-Down)%3A**%20Early%20social%20care%20and%20pharmacy%20coordination%2C%20avoiding%20costly%20hospital%20deconditioning.%0A%20%20%20%20%22%22%22)%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell(hide_code%3DTrue)%0Adef%20_(mo)%3A%0A%20%20%20%20mo.md(r%22%22%22%0A%20%20%20%20%23%23%20Tailoring%20Discharge%20to%20Clinical%20Need%0A%0A%20%20%20%20-%20**Diagnosis-Tailored%20Discharge%20Bundles%3A**%20Shifting%20ward%20practice%20from%20one-size-fits-all%20planning%20to%20targeted%2C%20multidisciplinary%20pathways%20aligned%20with%20the%20patient's%20primary%20diagnosis.%0A%20%20%20%20-%20**First%2048-Hour%20Protocol%3A**%20Frontloading%20diagnostic%20clarification%20early%20in%20the%20admission%20window%20to%20resolve%20clinical%20ambiguity%20before%20avoidable%20discharge%20delays%20build%20up.%0A%20%20%20%20%22%22%22)%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell%0Adef%20_(outline)%3A%0A%20%20%20%20outline(2)%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell%0Adef%20_(mo)%3A%0A%20%20%20%20mo.vstack(%5B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20mo.md(%22%23%23%20Assumed%20Causal%20Structure%20for%20Diagnosis%20and%20Length%20of%20Stay%22)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20mo.mermaid(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22%22%22%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20flowchart%20LR%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20X%5B%22Observed%20Confounders%20%3Cbr%2F%3E%20(Control%20Variables)%20%3Cbr%2F%3E%3Ci%20style%3D'font-family%3Aserif%3Bfont-size%3A4em%3B'%3EX%3C%2Fi%3E%22%5D%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20D%5B%22Diagnosis%3Cbr%2F%3E%3Ci%20style%3D'font-family%3Aserif%3Bfont-size%3A4em%3B'%3ED%3C%2Fi%3E%22%5D%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20Y%5B%22Length%20of%20Stay%3Cbr%2F%3E%3Ci%20style%3D'font-family%3Aserif%3Bfont-size%3A4em%3B'%3ELoS%3C%2Fi%3E%22%5D%0A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20X%20--%3E%20D%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20X%20--%3E%20Y%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20D%20--%3E%20Y%0A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20classDef%20covariate%20fill%3A%23dcefee%2Cstroke%3A%2320808D%2Cstroke-width%3A2px%2Ccolor%3A%23091717%3B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20classDef%20diagnosis%20fill%3A%23b7d5da%2Cstroke%3A%2320808D%2Cstroke-width%3A2px%2Ccolor%3A%23091717%3B%0A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20class%20X%2CY%20covariate%3B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20class%20D%20diagnosis%3B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22%22%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20theme%3D%22base%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20)%2C%0A%20%20%20%20%5D)%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell(hide_code%3DTrue)%0Adef%20_(mo)%3A%0A%20%20%20%20mo.md(r%22%22%22%0A%20%20%20%20%3C!--%20%23%23%20Double%20Machine%20Learning%20(DML)%3A%20A%20Robust%20Approach%20to%20Causal%20Inference%0A%0A%20%20%20%20-%20**Treatment%3A**%20For%20each%20diagnosis%2C%20define%20its%20presence%20as%20%24(D%3D1)%24%20and%20absence%20as%20%24(D%3D0)%24.%20The%20outcome%20%24Y%24%20is%20Length%20of%20Stay%20(LoS).%0A%0A%20%20%20%20-%20**Adjust%20for%20confounding%3A**%20Use%20observed%20patient%20and%20admission%20characteristics%20%24(X)%24%20to%20account%20for%20factors%20associated%20with%20both%20diagnosis%20and%20LoS.%0A%0A%20%20%20%20-%20**Learn%20with%20machine%20learning%3A**%20Estimate%20the%20expected%20LoS%2C%20%24(g(D%2CX)%3D%5Cmathbb%7BE%7D%5BY%5Cmid%20D%2CX%5D)%24%2C%20and%20the%20diagnosis%20propensity%2C%20%24(m(X)%3D%5CPr(D%3D1%5Cmid%20X))%24.%0A%0A%20%20%20%20-%20**Estimate%20the%20effect%3A**%20Combine%20these%20models%20in%20a%20doubly%20robust%2C%20orthogonal%20score%2C%20then%20average%20the%20predicted%20contrast%20between%20diagnosis%20present%20and%20absent%20across%20patients.%0A%0A%20%20%20%20-%20**Repeat%20for%20each%20diagnosis**%20to%20obtain%20diagnosis-specific%20average%20effects%20on%20LoS.%0A%0A%20%20%20%20**Interpretation%3A**%20These%20are%20adjusted%20population-average%20effects%2C%20not%20individual%20patient-level%20causal%20effects.%20A%20causal%20interpretation%20relies%20on%20adequate%20confounder%20adjustment%20and%20overlap%20between%20diagnosis%20groups.%20--%3E%0A%20%20%20%20%22%22%22)%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell%0Adef%20_()%3A%0A%20%20%20%20import%20io%20as%20_io%0A%20%20%20%20from%20urllib.request%20import%20urlopen%20as%20_urlopen%0A%0A%20%20%20%20import%20pandas%20as%20pd%0A%20%20%20%20import%20numpy%20as%20np%0A%20%20%20%20%23%20import%20seaborn%20as%20sns%0A%0A%20%20%20%20def%20fetch(url)%3A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%22%22%22Fetch%20remote%20data%20into%20memory%20before%20passing%20it%20to%20pandas.%0A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20Passing%20an%20in-memory%20buffer%20avoids%20pandas%20handling%20the%20compressed%20HTTP%0A%20%20%20%20%20%20%20%20response%20itself%20in%20the%20browser.%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%22%22%22%0A%20%20%20%20%20%20%20%20with%20_urlopen(url)%20as%20response%3A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20return%20_io.BytesIO(response.read())%0A%0A%0A%20%20%20%20data_url%20%3D%20(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%22https%3A%2F%2Fraw.githubusercontent.com%2F%22%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%22mustafaslanCoto%2Fmarimo-outputs%2Fmain%2F%22%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%22apps%2Fpublic%22%0A%20%20%20%20)%0A%20%20%20%20order_df%20%3D%20pd.read_csv(fetch(f%22%7Bdata_url%7D%2Fdiagnosis_order.csv%22))%0A%20%20%20%20diags%20%3D%20pd.read_csv(fetch(f%22%7Bdata_url%7D%2Fcaus_hrg_lgb.csv%22))%0A%20%20%20%20diags%20%3D%20diags.merge(order_df%2C%20on%3D'profile'%2C%20how%20%3D'left')%0A%20%20%20%20diags.rename(columns%3D%7B%22proportion%22%3A%20%22dominance%22%7D%2C%20inplace%3DTrue)%0A%20%20%20%20diags.sort_values(%22dominance%22%2C%20ascending%3DFalse%2C%20inplace%3DTrue)%0A%20%20%20%20%23%20diags%5B%22dominance%22%5D%20%3D%20diags%5B%22dominance%22%5D*100%0A%20%20%20%20cleand_df%20%3D%20pd.read_parquet(fetch(f%22%7Bdata_url%7D%2Fclean_df_present.parquet%22))%0A%20%20%20%20exist_codes%20%3D%20cleand_df%5Bcleand_df%5B%22code%22%5D!%3D%20%22%24%24X%22%5D%5B%22code%22%5D.drop_duplicates().tolist()%0A%0A%20%20%20%20diags%20%3D%20diags.drop(columns%3D%5B%22variance%22%5D)%0A%0A%20%20%20%20%23%20the%20desired%20order%20as%20a%20list%0A%20%20%20%20_order%20%3D%20order_df%5B%22profile%22%5D.tolist()%20%20%20%23%20adjust%20column%20name%20to%20match%20your%20file%0A%0A%20%20%20%20%23%20make%20diags'%20profile%20column%20an%20ordered%20categorical%0A%20%20%20%20diags%5B%22profile%22%5D%20%3D%20pd.Categorical(diags%5B%22profile%22%5D%2C%20categories%3D_order%2C%20ordered%3DTrue)%0A%0A%20%20%20%20%23%20sort%20by%20it%0A%20%20%20%20diags%20%3D%20diags.sort_values(%22profile%22).reset_index(drop%3DTrue)%0A%0A%20%20%20%20confounders%20%3D%20pd.read_csv(fetch(f%22%7Bdata_url%7D%2Fconfounders.csv%22))%0A%20%20%20%20return%20cleand_df%2C%20confounders%2C%20data_url%2C%20diags%2C%20exist_codes%2C%20fetch%2C%20np%2C%20pd%0A%0A%0A%40app.cell%0Adef%20_(diags)%3A%0A%20%20%20%20hrg_est%20%3D%20diags%5B%22profile%22%5D.tolist()%0A%20%20%20%20return%20(hrg_est%2C)%0A%0A%0A%40app.cell%0Adef%20_(data_url%2C%20exist_codes%2C%20fetch%2C%20pd)%3A%0A%20%20%20%20hrg%20%3D%20pd.read_csv(fetch(f%22%7Bdata_url%7D%2Fnhs_group.csv%22))%5B%5B%22code%22%2C%20%22HRG%201%22%2C%22Code%20Description%22%5D%5D.drop_duplicates().rename(columns%3D%7B%22code%22%3A%22ICD_code%22%2C%20%22HRG%201%22%3A%20%22HRG%22%2C%20%22Code%20Description%22%3A%20%22ICD_description%22%7D)%0A%20%20%20%20%23%23%20filter%20ICD%0A%20%20%20%20hrg%20%3D%20hrg%5Bhrg%5B%22ICD_code%22%5D.isin(exist_codes)%5D%0A%20%20%20%20hrg%5B%22HRG2%22%5D%20%3D%20hrg%5B%22HRG%22%5D.str%5B%3A2%5D%0A%20%20%20%20return%20(hrg%2C)%0A%0A%0A%40app.cell%0Adef%20_(hrg%2C%20hrg_est%2C%20np)%3A%0A%20%20%20%20hrg%5B%22isin_est%22%5D%20%3D%20hrg%5B%22HRG2%22%5D.isin(hrg_est)%20%7C%20hrg%5B%22HRG%22%5D.isin(hrg_est)%0A%20%20%20%20hrg_in%20%3D%20hrg%5Bhrg%5B%22isin_est%22%5D%20%3D%3D%20True%5D.copy()%0A%20%20%20%20%23%23%20create%20another%20column%20if%20the%20value%20of%20HRG%20is%20in%20the%20estimated%20list%20take%20it%20from%20HRG%20column%20otwerwise%20take%20it%20from%20HRG2%20column%0A%20%20%20%20hrg_in.loc%5B%3A%2C%20%22HRG_final%22%5D%20%3D%20np.where(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20hrg_in%5B%22HRG%22%5D.isin(hrg_est)%2C%20%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20hrg_in%5B%22HRG%22%5D%2C%20%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20hrg_in%5B%22HRG2%22%5D%0A%20%20%20%20)%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell%0Adef%20_()%3A%0A%20%20%20%20%23%20mo.ui.table(diags.round(2)%2C%20pagination%3DTrue%2C%20page_size%3D15)%0A%20%20%20%20%23%20cleand_df%5Bcleand_df%5B%22code%22%5D!%3D%22%24%24X%22%5D%5B%22code%22%5D.value_counts(normalize%3DTrue).cumsum()%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell%0Adef%20_(confounders%2C%20mo)%3A%0A%20%20%20%20_names%20%3D%20confounders%5B%22confounder%22%5D.dropna().astype(str).tolist()%0A%20%20%20%20_mid%20%3D%20(len(_names)%20%2B%201)%20%2F%2F%202%0A%0A%20%20%20%20_left%20%3D%20mo.md(%22%5Cn%22.join(f%22-%20%60%7Bname%7D%60%22%20for%20name%20in%20_names%5B%3A_mid%5D))%0A%20%20%20%20_right%20%3D%20mo.md(%22%5Cn%22.join(f%22-%20%60%7Bname%7D%60%22%20for%20name%20in%20_names%5B_mid%3A%5D))%0A%0A%20%20%20%20mo.vstack(%5B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20mo.md(f%22%23%23%20Confounders%20(%7Blen(_names)%7D)%5Cn%5CnCovariates%20included%20in%20%24X%24%22)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20mo.hstack(%5B_left%2C%20_right%5D%2C%20widths%3D%5B0.5%2C%200.5%5D%2C%20align%3D%22start%22%2C%20gap%3D1)%2C%0A%20%20%20%20%5D)%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell(hide_code%3DTrue)%0Adef%20_(mo)%3A%0A%20%20%20%20mo.md(r%22%22%22%0A%20%20%20%20%23%23%20Double%20Machine%20Learning%20(DML)%3A%20A%20Robust%20Approach%20to%20Causal%20Inference%0A%0A%20%20%20%20For%20each%20diagnosis%2C%20let%20%24D%3D1%24%20indicate%20its%20presence%20and%20%24D%3D0%24%20its%20absence.%20Let%20%24LoS%24%20denote%20Length%20of%20Stay%2C%20and%20%24X%24%20the%20observed%20confounders.%0A%0A%20%20%20%20The%20average%20predictive%20effect%2C%20%24%5Ctheta_0%24%2C%20compares%20the%20expected%20%24LoS%24%20with%20the%20diagnosis%20present%20versus%20absent%2C%20averaged%20over%20patients'%20observed%20characteristics%3A%0A%0A%20%20%20%20%24%24%0A%20%20%20%20%5Ctheta_0%0A%20%20%20%20%3D%0A%20%20%20%20%5Cmathbb%7BE%7D%5C!%5Cleft%5Bg_0(1%2CX)-g_0(0%2CX)%5Cright%5D.%0A%20%20%20%20%24%24%0A%0A%20%20%20%20The%20outcome%20and%20diagnosis%20are%20modelled%20using%20the%20following%20regression%20equations%3A%0A%0A%20%20%20%20%24%24%0A%20%20%20%20%5Cbegin%7Baligned%7D%0A%20%20%20%20LoS%20%26%3D%20g_0(D%2CX)%20%2B%20%5Cvarepsilon%2C%0A%20%20%20%20%26%5Cquad%20%5Cmathbb%7BE%7D%5B%5Cvarepsilon%20%5Cmid%20X%2CD%5D%20%26%3D%200%2C%20%5C%5C%0A%20%20%20%20D%20%26%3D%20m_0(X)%20%2B%20%5Cwidetilde%7BD%7D%2C%0A%20%20%20%20%26%5Cquad%20%5Cmathbb%7BE%7D%5B%5Cwidetilde%7BD%7D%20%5Cmid%20X%5D%20%26%3D%200.%0A%20%20%20%20%5Cend%7Baligned%7D%0A%20%20%20%20%24%24%0A%0A%20%20%20%20Here%2C%20%24g_0(D%2CX)%24%20is%20the%20regression%20function%20for%20%24LoS%24%2C%20while%20%24m_0(X)%24%20is%20the%20classification%20function%20for%20the%20diagnosis%20given%20the%20confounders.%0A%0A%20%20%20%20Building%20on%20these%20two%20regression%20models%2C%20we%20construct%20an%20efficient%20estimator%20of%20the%20average%20predictive%20effect%20using%20the%20following%20orthogonal%20score%3A%0A%0A%20%20%20%20%24%24%0A%20%20%20%20%5Ctheta_0%20%3D%20%5Cmathbb%7BE%7D%5C!%5Cleft%5B%5Cvarphi_0(W)%5Cright%5D%2C%0A%20%20%20%20%5Cqquad%20W%3D(LoS%2CD%2CX)%2C%0A%20%20%20%20%24%24%0A%0A%20%20%20%20where%0A%0A%20%20%20%20%24%24%0A%20%20%20%20%5Cvarphi_0(W)%0A%20%20%20%20%3D%0A%20%20%20%20g_0(1%2CX)-g_0(0%2CX)%0A%20%20%20%20%2B%0A%20%20%20%20%5Cbigl(LoS-g_0(D%2CX)%5Cbigr)H_0%2C%0A%20%20%20%20%24%24%0A%0A%20%20%20%20and%0A%0A%20%20%20%20%24%24%0A%20%20%20%20H_0%0A%20%20%20%20%3D%0A%20%20%20%20%5Cfrac%7B%5Cmathbf%7B1%7D(D%3D1)%7D%7Bm_0(X)%7D%0A%20%20%20%20-%0A%20%20%20%20%5Cfrac%7B%5Cmathbf%7B1%7D(D%3D0)%7D%7B1-m_0(X)%7D.%0A%20%20%20%20%24%24%0A%0A%20%20%20%20Here%2C%20%24%5Cmathbf%7B1%7D(%5Ccdot)%24%20is%20an%20indicator%20function%2C%20and%20%24H_0%24%20is%20the%20Horvitz-Thompson%20transformation.%0A%20%20%20%20%22%22%22)%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell%0Adef%20_(outline)%3A%0A%20%20%20%20outline(3)%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell(hide_code%3DTrue)%0Adef%20_(mo)%3A%0A%20%20%20%20mo.md(r%22%22%22%0A%20%20%20%20%23%23%23%20Causal%20Effect%20Sizes%20of%20Diagnosis%20on%20LoS%0A%20%20%20%20%22%22%22)%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell%0Adef%20_(diags%2C%20mo%2C%20np%2C%20pd)%3A%0A%20%20%20%20import%20altair%20as%20alt%0A%0A%20%20%20%20clinical_names%20%3D%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'HE11'%3A%20'Hip%20%26%20Femur%20Fractures'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'HE'%3A%20'Musculoskeletal%20Trauma'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'DZ11'%3A%20'Severe%20Pneumonia%20%26%20Lung%20Infection'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'EB10'%3A%20'Heart%20Attack%20%26%20Cardiac%20Shock'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'WJ'%3A%20'Sepsis%20%26%20Severe%20Systemic%20Infection'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'HC'%3A%20'Spinal%20%26%20Joint%20Disorders'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'AA'%3A%20'Stroke%20%26%20Acute%20Neurological'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'unknown'%3A%20'%E2%98%85%20Diagnostic%20Ambiguity%20(Uncoded%20Stay)'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'HD'%3A%20'Bone%20%26%20Soft-Tissue%20Musculoskeletal'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'FD11'%3A%20'Digestive%20%26%20Oesophageal%20Cancers'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'AA26'%3A%20'Cerebrovascular%20%26%20Nerve%20Disorders'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'LA04'%3A%20'Severe%20Kidney%20Infection%20%2F%20Pyelonephritis'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'YQ50'%3A%20'Arterial%20Thrombosis%20%26%20Vascular%20Disease'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'EB14'%3A%20'Cardiomyopathy%20%26%20Heart%20Disease'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'EB'%3A%20'Valvular%20%26%20Inflammatory%20Heart%20Disease'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'DZ'%3A%20'Chronic%20Respiratory%20Conditions'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'KC'%3A%20'Metabolic%20%26%20Electrolyte%20Disorders'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'LA'%3A%20'Kidney%20%26%20Urinary%20Conditions'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'EB07'%3A%20'Cardiac%20Arrhythmias%20%26%20Conduction'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'JD07'%3A%20'Skin%20%26%20Subcutaneous%20Conditions'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'GC17'%3A%20'Liver%20%26%20Pancreatic%20Conditions'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'WH'%3A%20'General%20Clinical%20Surveillance'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'LB38'%3A%20'Urinary%20Symptoms%20%26%20Haematuria'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'MB'%3A%20'Gynaecological%20Conditions'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'CB'%3A%20'Oral%20%26%20Upper%20Respiratory'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'FD'%3A%20'Gastrointestinal%20Infections'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'LB'%3A%20'Bladder%20%26%20Kidney%20Disorders'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'FD10'%3A%20'General%20Intestinal%20Disorders'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'FD02'%3A%20'Inflammatory%20Bowel%20Disease'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'DZ65'%3A%20'Chronic%20Bronchitis%20%26%20COPD'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'FD03'%3A%20'Peptic%20Ulcer%20%26%20GI%20Bleeding'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'SA04'%3A%20'Iron%20Deficiency%20Anaemia'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'DZ19'%3A%20'Wheezing%20%26%20Bronchospasm'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'EB12'%3A%20'Non-cardiac%20Chest%20Pain'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'FD05'%3A%20'Non-specific%20Abdominal%20Pain'%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'WH52'%3A%20'Post-Surgical%20Cancer%20Surveillance'%0A%20%20%20%20%7D%0A%0A%20%20%20%20def%20create_clinical_forest_plot(df%3A%20pd.DataFrame%2C%20top_n%3A%20int%20%3D%2036)%20-%3E%20alt.Chart%20%7C%20mo.Html%3A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20if%20df.empty%3A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20return%20mo.md(%22*No%20effect%20size%20data%20available.*%22)%0A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20required_cols%20%3D%20%5B%22profile%22%2C%20%22ate_days%22%2C%20%22ci_low%22%2C%20%22ci_high%22%2C%20%22dominance%22%5D%0A%20%20%20%20%20%20%20%20missing_cols%20%3D%20set(required_cols)%20-%20set(df.columns)%0A%20%20%20%20%20%20%20%20if%20missing_cols%3A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20return%20mo.md(f%22*Missing%20required%20columns%3A%20%60%7Blist(missing_cols)%7D%60*%22)%0A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%23%20Clean%2C%20map%20names%2C%20identify%20intervals%20crossing%20zero%2C%20and%20sort%0A%20%20%20%20%20%20%20%20clean_df%20%3D%20(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20df.dropna(subset%3Drequired_cols)%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20.assign(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20abs_ate%3Dlambda%20x%3A%20x%5B%22ate_days%22%5D.abs()%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20dominance_pct%3Dlambda%20x%3A%20x%5B%22dominance%22%5D%20*%20100%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20clinical_name%3Dlambda%20x%3A%20x%5B%22profile%22%5D.astype(str).map(clinical_names).fillna(x%5B%22profile%22%5D.astype(str))%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20display_label%3Dlambda%20x%3A%20x.apply(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20lambda%20r%3A%20f%22%7Br%5B'clinical_name'%5D%7D%20(%7Br%5B'profile'%5D%7D)%22%20if%20r%5B%22clinical_name%22%5D%20!%3D%20str(r%5B%22profile%22%5D)%20else%20str(r%5B%22profile%22%5D)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20axis%3D1%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%23%20Check%20whether%200%20falls%20inside%20%5Bci_low%2C%20ci_high%5D%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20crosses_zero%3Dlambda%20x%3A%20(x%5B%22ci_low%22%5D%20%3C%3D%200)%20%26%20(x%5B%22ci_high%22%5D%20%3E%3D%200)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20effect_dir%3Dlambda%20x%3A%20np.select(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%5B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20x%5B%22crosses_zero%22%5D%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20x%5B%22ate_days%22%5D%20%3E%200%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%5D%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%5B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22Not%20Significant%20(CI%20spans%200)%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22Increases%20LoS%20(%2B%20Days)%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%5D%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20default%3D%22Decreases%20LoS%20(-%20Days)%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20)%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20.sort_values(by%3D%22abs_ate%22%2C%20ascending%3DFalse)%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20.head(top_n)%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20.sort_values(by%3D%22ate_days%22%2C%20ascending%3DFalse)%20%20%23%20Highest%20positive%20at%20top%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20.reset_index(drop%3DTrue)%0A%20%20%20%20%20%20%20%20)%0A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20if%20clean_df.empty%3A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20return%20mo.md(%22*No%20valid%20numeric%20rows%20found%20after%20cleaning.*%22)%0A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20y_order%20%3D%20clean_df%5B%22display_label%22%5D.tolist()%0A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%23%20Y-encoding%20with%20horizontal%20grid%20and%20colored%20Ambiguity%20label%0A%20%20%20%20%20%20%20%20y_encoding%20%3D%20alt.Y(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22display_label%3AN%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20title%3DNone%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20sort%3Dy_order%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20axis%3Dalt.Axis(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20labelFontSize%3D12%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20labelLimit%3D380%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20ticks%3DFalse%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20domainColor%3D%22%23CBD5E1%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20grid%3DTrue%2C%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%23%20Horizontal%20grid%20enabled%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20gridColor%3D%22rgba(203%2C%20213%2C%20225%2C%200.45)%22%2C%20%20%23%20Soft%20neutral%20divider%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20gridDash%3D%5B2%2C%202%5D%2C%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%23%20Subtle%20dashed%20style%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20gridWidth%3D1%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20labelColor%3Dalt.expr(%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%23%20Red%20label%20for%20Diagnostic%20Ambiguity%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22indexof(datum.value%2C%20'Diagnostic%20Ambiguity')%20%3E%3D%200%20%3F%20'%23B91C1C'%20%3A%20'%23334155'%22%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20labelFontWeight%3Dalt.expr(%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%23%20Bold%20text%20for%20Diagnostic%20Ambiguity%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22indexof(datum.value%2C%20'Diagnostic%20Ambiguity')%20%3E%3D%200%20%3F%20'bold'%20%3A%20'normal'%22%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20)%0A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%23%203-color%20palette%3A%20Red%20(increases)%2C%20Teal%20(decreases)%2C%20Grey%20(spans%20zero)%0A%20%20%20%20%20%20%20%20color_scale%20%3D%20alt.Scale(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20domain%3D%5B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22Increases%20LoS%20(%2B%20Days)%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22Decreases%20LoS%20(-%20Days)%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22Not%20Significant%20(CI%20spans%200)%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%5D%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20range%3D%5B%22%23E53E3E%22%2C%20%22%23319795%22%2C%20%22%2394A3B8%22%5D%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20)%0A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20base%20%3D%20alt.Chart(clean_df)%0A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%23%200.%20Horizontal%20shaded%20band%20behind%20the%20Diagnostic%20Ambiguity%20row%0A%20%20%20%20%20%20%20%20ambiguity_band%20%3D%20base.transform_filter(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20alt.datum.profile%20%3D%3D%20%22unknown%22%0A%20%20%20%20%20%20%20%20).mark_rule(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20color%3D%22%23FEE2E2%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20strokeWidth%3D24%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20opacity%3D0.75%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20).encode(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20y%3Dy_encoding%0A%20%20%20%20%20%20%20%20)%0A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%23%201.%20Zero%20dashed%20baseline%20rule%0A%20%20%20%20%20%20%20%20zero_line%20%3D%20alt.Chart().mark_rule(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20color%3D%22%2364748B%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20strokeWidth%3D1.5%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20strokeDash%3D%5B5%2C%205%5D%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20).encode(x%3Dalt.datum(0))%0A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%23%202.%2095%25%20Confidence%20Interval%20error%20bars%0A%20%20%20%20%20%20%20%20error_bars%20%3D%20base.mark_rule(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20strokeWidth%3D2.2%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20).encode(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20x%3Dalt.X(%22ci_low%3AQ%22)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20x2%3D%22ci_high%3AQ%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20y%3Dy_encoding%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20color%3Dalt.Color(%22effect_dir%3AN%22%2C%20scale%3Dcolor_scale%2C%20legend%3DNone)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20)%0A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%23%203.%20Effect%20size%20circles%20scaled%20by%20Dominance%20%25%0A%20%20%20%20%20%20%20%20points%20%3D%20base.mark_circle(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20stroke%3D%22%231E293B%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20strokeWidth%3D1.2%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20opacity%3D0.95%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20).encode(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20x%3Dalt.X(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22ate_days%3AQ%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20title%3D%22Causal%20Effect%20Sizes%20of%20Diagnosis%20on%20Hospital%20Length%20of%20Stay%20in%20Days%20(95%25%20CI)%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20axis%3Dalt.Axis(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20orient%3D%22top%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20grid%3DTrue%2C%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%23%20Vertical%20grid%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20gridColor%3D%22rgba(160%2C%20174%2C%20192%2C%200.25)%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20titleFontSize%3D13%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20labelFontSize%3D11%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20titlePadding%3D12%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20y%3Dy_encoding%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20size%3Dalt.Size(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22dominance_pct%3AQ%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20title%3D%22Dominance%20(%25)%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20scale%3Dalt.Scale(range%3D%5B80%2C%20520%5D)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20legend%3Dalt.Legend(titleFontSize%3D12%2C%20labelFontSize%3D11%2C%20orient%3D%22right%22)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20color%3Dalt.Color(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22effect_dir%3AN%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20title%3D%22Causal%20Significance%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20scale%3Dcolor_scale%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20legend%3Dalt.Legend(titleFontSize%3D12%2C%20labelFontSize%3D11%2C%20orient%3D%22right%22)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20tooltip%3D%5B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20alt.Tooltip(%22clinical_name%3AN%22%2C%20title%3D%22Clinical%20Group%22)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20alt.Tooltip(%22profile%3AN%22%2C%20title%3D%22HRG%20Code%22)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20alt.Tooltip(%22ate_days%3AQ%22%2C%20title%3D%22ATE%20(Days)%22%2C%20format%3D%22%2B.2f%22)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20alt.Tooltip(%22ci_low%3AQ%22%2C%20title%3D%2295%25%20CI%20Lower%22%2C%20format%3D%22.2f%22)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20alt.Tooltip(%22ci_high%3AQ%22%2C%20title%3D%2295%25%20CI%20Upper%22%2C%20format%3D%22.2f%22)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20alt.Tooltip(%22dominance_pct%3AQ%22%2C%20title%3D%22Dominance%20(%25)%22%2C%20format%3D%22.2f%22)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20alt.Tooltip(%22effect_dir%3AN%22%2C%20title%3D%22Significance%22)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%5D%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20)%0A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%23%204.%20Inline%20text%20note%20right%20beside%20the%20Diagnostic%20Ambiguity%20whisker%0A%20%20%20%20%20%20%20%20ambiguity_note%20%3D%20base.transform_filter(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20alt.datum.profile%20%3D%3D%20%22unknown%22%0A%20%20%20%20%20%20%20%20).mark_text(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20align%3D%22left%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20baseline%3D%22middle%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20dx%3D16%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20fontSize%3D11%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20fontWeight%3D%22bold%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20color%3D%22%23B91C1C%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20text%3D%22%E2%86%90%20%2B2.53%20days%20delay%20(28.0%25%20of%20all%20admissions)%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20).encode(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20x%3D%22ci_high%3AQ%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20y%3Dy_encoding%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20)%0A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20return%20(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20(ambiguity_band%20%2B%20zero_line%20%2B%20error_bars%20%2B%20points%20%2B%20ambiguity_note)%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20.properties(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20width%3D980%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20height%3Dmax(360%2C%20len(clean_df)%20*%2022)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20background%3D%22transparent%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20)%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20.configure_view(stroke%3DNone)%0A%20%20%20%20%20%20%20%20)%0A%0A%20%20%20%20create_clinical_forest_plot(diags%2C%20top_n%3D36)%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell(hide_code%3DTrue)%0Adef%20_(mo)%3A%0A%20%20%20%20mo.md(r%22%22%22%0A%20%20%20%20%23%23%20Attributable%20bed-days%20from%20the%20uncoded%20group%20and%20codes%20increasing%20LoS%0A%20%20%20%20%22%22%22)%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell%0Adef%20_()%3A%0A%20%20%20%20%23%20cleand_df%5Bcleand_df%5B%22code%22%5D%20%3D%3D%20%22%24%24X%22%5D%5B%22PATIENT_SPECIALTY%22%5D.value_counts(normalize%3DTrue)%0A%20%20%20%20%23%20cleand_df%5Bcleand_df%5B%22code%22%5D%20!%3D%20%22%24%24X%22%5D%5B%22PATIENT_SPECIALTY%22%5D.value_counts(normalize%3DTrue)%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell%0Adef%20_(diags%2C%20mo)%3A%0A%20%20%20%20%23%201.%20Dynamically%20build%20options%20for%20all%20groups%20with%20positive%20ATE%20days%0A%20%20%20%20pos_diags%20%3D%20diags%5B(diags%5B%22ate_days%22%5D%20%3E%200)%20%26%20(diags%5B%22ci_low%22%5D%20%3E%200)%5D.copy()%0A%20%20%20%20_clin_map%20%3D%20globals().get(%22clinical_names%22%2C%20%7B%7D)%0A%0A%20%20%20%20my_options%20%3D%20%7B%7D%0A%0A%20%20%20%20for%20_%2C%20row%20in%20pos_diags.iterrows()%3A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20prof%20%3D%20str(row%5B%22profile%22%5D)%0A%20%20%20%20%20%20%20%20ate%20%3D%20row%5B%22ate_days%22%5D%0A%20%20%20%20%20%20%20%20dom%20%3D%20row%5B%22dominance%22%5D%20*%20100%20if%20row%5B%22dominance%22%5D%20%3C%3D%201%20else%20row%5B%22dominance%22%5D%0A%20%20%20%20%20%20%20%20icon%20%3D%20%22%F0%9F%93%81%22%20if%20prof%20%3D%3D%20%22unknown%22%20else%20%22%F0%9F%8F%A5%22%0A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20if%20prof%20%3D%3D%20%22unknown%22%3A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20label_text%20%3D%20%22Uncoded%20Group%22%0A%20%20%20%20%20%20%20%20else%3A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20clin%20%3D%20_clin_map.get(prof%2C%20%22%22)%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20clin_short%20%3D%20f%22%20(%7Bclin.split('%26')%5B0%5D.split('%2F')%5B0%5D.strip()%5B%3A14%5D%7D)%22%20if%20clin%20else%20%22%22%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20label_text%20%3D%20f%22%7Bprof%7D%7Bclin_short%7D%22%0A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20display_str%20%3D%20f%22%7Bicon%7D%20%7Blabel_text%7D%20(%2B%7Bate%3A.2f%7Dd%20%C2%B7%20%7Bdom%3A.1f%7D%25)%22%0A%20%20%20%20%20%20%20%20my_options%5Bdisplay_str%5D%20%3D%20prof%0A%0A%20%20%20%20label_style%20%3D%20%22font-size%3A%2013px%3B%20font-weight%3A%20600%3B%20color%3A%20%23475569%3B%20display%3A%20block%3B%20margin-bottom%3A%204px%3B%22%0A%0A%20%20%20%20default_key%20%3D%20next(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20(k%20for%20k%2C%20v%20in%20my_options.items()%20if%20v%20%3D%3D%20%22unknown%22)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20list(my_options.keys())%5B0%5D%2C%0A%20%20%20%20)%0A%0A%20%20%20%20%23%201.%20Multi-select%20with%20rich%20labels%0A%20%20%20%20group_select%20%3D%20mo.ui.multiselect(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20options%3Dmy_options%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20value%3D%5Bdefault_key%5D%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20label%3D%22%22%2C%0A%20%20%20%20)%0A%0A%20%20%20%20%23%202.%20Causal%20Estimator%20Dropdown%0A%20%20%20%20metric_options%20%3D%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%22%F0%9F%93%8A%20Point%20Estimate%20(ATE%20-%20Mean)%22%3A%20%22ate_days%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%22%F0%9F%93%89%20Conservative%20(CI%20Lower%20Bound)%22%3A%20%22ci_low%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%22%F0%9F%93%88%20Aggressive%20(CI%20Upper%20Bound)%22%3A%20%22ci_high%22%2C%0A%20%20%20%20%7D%0A%0A%20%20%20%20metric_select%20%3D%20mo.ui.dropdown(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20options%3Dmetric_options%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20value%3D%22%F0%9F%93%8A%20Point%20Estimate%20(ATE%20-%20Mean)%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20label%3D%22%22%2C%0A%20%20%20%20)%0A%0A%20%20%20%20%23%203.%20Success%20Rate%20Slider%0A%20%20%20%20success_rate%20%3D%20mo.ui.slider(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20start%3D0%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20stop%3D100%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20step%3D5%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20value%3D100%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20label%3D%22%22%2C%0A%20%20%20%20)%0A%0A%20%20%20%20%23%20Columns%20with%20overflow%3A%20visible%20so%20popovers%20and%20badges%20aren't%20clipped%0A%20%20%20%20col1%20%3D%20mo.vstack(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%5B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20mo.md(f%22%3Cspan%20style%3D'%7Blabel_style%7D'%3ESelect%20Diagnoses%3A%3C%2Fspan%3E%22)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20group_select%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%5D%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20gap%3D0.3%2C%0A%20%20%20%20).style(%7B%22flex%22%3A%20%221.8%22%2C%20%22min-width%22%3A%20%220%22%2C%20%22overflow%22%3A%20%22visible%22%7D)%0A%0A%20%20%20%20col2%20%3D%20mo.vstack(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%5B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20mo.md(f%22%3Cspan%20style%3D'%7Blabel_style%7D'%3EEstimator%3A%3C%2Fspan%3E%22)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20metric_select%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%5D%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20gap%3D0.3%2C%0A%20%20%20%20).style(%7B%22flex%22%3A%20%220.9%22%2C%20%22min-width%22%3A%20%220%22%2C%20%22overflow%22%3A%20%22visible%22%7D)%0A%0A%20%20%20%20col3%20%3D%20mo.vstack(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%5B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20mo.md(f%22%3Cspan%20style%3D'%7Blabel_style%7D'%3ESuccess%20Rate%20(%25)%3A%3C%2Fspan%3E%22)%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20success_rate%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%5D%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20gap%3D0.3%2C%0A%20%20%20%20).style(%7B%22flex%22%3A%20%220.9%22%2C%20%22min-width%22%3A%20%220%22%2C%20%22overflow%22%3A%20%22visible%22%7D)%0A%0A%20%20%20%20_custom_css_and_script%20%3D%20mo.Html(%22%22%22%0A%20%20%20%20%3Cstyle%3E%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%2F*%20Ensure%20multiselect%20fits%20the%20column%20cleanly%20*%2F%0A%20%20%20%20%20%20%20%20marimo-multiselect%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20width%3A%20100%25%20!important%3B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20display%3A%20block%20!important%3B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%2F*%20Only%20limit%20the%20trigger%20bar%2C%20NOT%20the%20buttons%20inside%20the%20dropdown%20*%2F%0A%20%20%20%20%20%20%20%20marimo-multiselect%20%3E%20div%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20marimo-multiselect%20div%5Brole%3D%22combobox%22%5D%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20max-height%3A%2038px%20!important%3B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20overflow-x%3A%20auto%20!important%3B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20overflow-y%3A%20hidden%20!important%3B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20white-space%3A%20nowrap%20!important%3B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20flex-wrap%3A%20nowrap%20!important%3B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%2F*%20Elevate%20popover%20menu%20above%20fullscreen%20slides%20*%2F%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%5Bdata-radix-popper-content-wrapper%5D%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20div%5Brole%3D%22dialog%22%5D%5Bdata-state%3D%22open%22%5D%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20div%5Brole%3D%22listbox%22%5D%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20z-index%3A%209999999%20!important%3B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20pointer-events%3A%20auto%20!important%3B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20select%20%7B%20%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20width%3A%20100%25%20!important%3B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20font-size%3A%2013px%20!important%3B%20%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20padding%3A%206px%2010px%20!important%3B%20%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20border-radius%3A%206px%20!important%3B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20border%3A%201px%20solid%20%23cbd5e1%20!important%3B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20background-color%3A%20%23ffffff%20!important%3B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20cursor%3A%20pointer%20!important%3B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%20%20input%5Btype%3Drange%5D%20%7B%20%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20cursor%3A%20pointer%3B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20width%3A%20100%25%20!important%3B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%3C%2Fstyle%3E%0A%0A%20%20%20%20%3Cscript%3E%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%2F%2F%20Prevent%20Reveal.js%20fullscreen%20event%20handlers%20from%20intercepting%20multiselect%20clicks%20%26%20typing%0A%20%20%20%20%20%20%20%20(function()%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20function%20stopSlideInterception(e)%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20if%20(e.target%20%26%26%20(e.target.closest('%5Bdata-radix-popper-content-wrapper%5D')%20%7C%7C%20e.target.closest('marimo-multiselect')))%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20e.stopPropagation()%3B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%5B'pointerdown'%2C%20'mousedown'%2C%20'mouseup'%2C%20'click'%2C%20'keydown'%2C%20'keyup'%5D.forEach(function(evt)%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20document.addEventListener(evt%2C%20stopSlideInterception%2C%20true)%3B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%7D)%3B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D)()%3B%0A%20%20%20%20%3C%2Fscript%3E%0A%20%20%20%20%22%22%22)%0A%0A%20%20%20%20controls_display%20%3D%20mo.hstack(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%5Bcol1%2C%20col2%2C%20col3%5D%2C%20justify%3D%22space-between%22%2C%20align%3D%22start%22%2C%20gap%3D3%0A%20%20%20%20).style(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20style%3D%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22padding%22%3A%20%2212px%2018px%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22background-color%22%3A%20%22%23f8fafc%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22border-radius%22%3A%20%2210px%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22border%22%3A%20%221px%20solid%20%23e2e8f0%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22width%22%3A%20%22100%25%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20)%0A%0A%20%20%20%20mo.vstack(%5B_custom_css_and_script%2C%20controls_display%5D)%0A%20%20%20%20return%20group_select%2C%20metric_select%2C%20success_rate%0A%0A%0A%40app.cell%0Adef%20_()%3A%0A%20%20%20%20%23%20%23%23%20filter%20rows%20where%20there%20is%20no%200%20between%20ci_low%20and%20ci_high%0A%20%20%20%20%23%20suc_rate%20%3D%200.2%0A%20%20%20%20%23%20_test_cut%20%3D%20%222025-03-01%22%0A%20%20%20%20%23%20_clean_test%20%3D%20cleand_df%5Bcleand_df%5B%22HS_START_DATE%22%5D%20%3E%3D%20test_cut%5D%0A%20%20%20%20%23%20sign_diaglist%20%3D%20diags%5B(~((diags%5B'ci_low'%5D%20%3C%3D%200)%20%26%20(diags%5B'ci_high'%5D%20%3E%3D%200)))%20%26%20(diags%5B'ate_days'%5D%20%3E%200)%20%5D%5B%22profile%22%5D.tolist()%0A%20%20%20%20%23%20sign_diagdf%20%3D%20_clean_test%5B_clean_test%5B%22group%22%5D.isin(sign_diaglist)%5D%0A%20%20%20%20%23%20sign_diagdf%20%3D%20sign_diagdf.merge(diags%5B%5B%22profile%22%2C%20%22ate_days%22%5D%5D%2C%20left_on%3D%22group%22%2C%20right_on%3D%22profile%22%2C%20how%3D%22left%22).drop(columns%3D%5B%22profile%22%5D)%0A%0A%0A%20%20%20%20%23%20%23%23%20calcualate%20total%20bed-days%20and%20excess%20bed-days%20caused%20by%20the%20significant%20diagnosis%20groups%0A%20%20%20%20%23%20total_bed_days%20%3D%20cleand_df%5B%22spell_los%22%5D.sum()%0A%20%20%20%20%23%20excess_bed_days%20%3D%20sign_diagdf%5B%22ate_days%22%5D.sum()*suc_rate%0A%20%20%20%20%23%20%23%23%20calculate%20the%20percentage%20of%20excess%20bed-days%20caused%20by%20the%20significant%20diagnosis%20groups%0A%20%20%20%20%23%20excess_percentage%20%3D%20(excess_bed_days%20%2F%20total_bed_days)%20*%20100%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell%0Adef%20_(cleand_df%2C%20diags%2C%20group_select%2C%20metric_select%2C%20mo%2C%20success_rate)%3A%0A%20%20%20%20%23%20Counterfactual%20calculations%0A%20%20%20%20test_cut%20%3D%20%222025-03-01%22%0A%20%20%20%20clean_test%20%3D%20cleand_df%5Bcleand_df%5B%22HS_START_DATE%22%5D%20%3E%3D%20test_cut%5D%0A%20%20%20%20total_admits%20%3D%20clean_test.shape%5B0%5D%0A%0A%20%20%20%20positive_groups%20%3D%20diags%5Bdiags%5B%22ate_days%22%5D%20%3E%200%5D%5B%22profile%22%5D.tolist()%0A%0A%20%20%20%20selected_groups%20%3D%20group_select.value%0A%20%20%20%20if%20not%20isinstance(selected_groups%2C%20list)%3A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20selected_groups%20%3D%20%5Bselected_groups%5D%0A%0A%20%20%20%20if%20not%20selected_groups%3A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20selected_groups%20%3D%20positive_groups%0A%0A%20%20%20%20active_diag%20%3D%20clean_test%5Bclean_test%5B%22group%22%5D.isin(selected_groups)%5D%0A%20%20%20%20num_admits%20%3D%20active_diag.shape%5B0%5D%0A%0A%20%20%20%20_clin_map%20%3D%20globals().get(%22clinical_names%22%2C%20%7B%7D)%0A%20%20%20%20if%20len(selected_groups)%20%3D%3D%201%3A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20_p0%20%3D%20selected_groups%5B0%5D%0A%20%20%20%20%20%20%20%20group_label%20%3D%20(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22Uncoded%20Group%22%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20if%20_p0%20%3D%3D%20%22unknown%22%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20else%20_clin_map.get(_p0%2C%20f%22Group%20'%7B_p0%7D'%22)%0A%20%20%20%20%20%20%20%20)%0A%20%20%20%20%20%20%20%20banner_context%20%3D%20f%22**%7Bgroup_label%7D**%22%0A%20%20%20%20elif%20set(selected_groups)%20%3D%3D%20set(positive_groups)%3A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20group_label%20%3D%20%22All%20Positive%20Groups%22%0A%20%20%20%20%20%20%20%20banner_context%20%3D%20f%22across%20**All%20%7Blen(selected_groups)%7D%20Positive%20Groups**%22%0A%20%20%20%20else%3A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20group_label%20%3D%20f%22%7Blen(selected_groups)%7D%20Selected%20Groups%22%0A%20%20%20%20%20%20%20%20banner_context%20%3D%20f%22across%20**%7Blen(selected_groups)%7D%20Selected%20Groups**%22%0A%0A%20%20%20%20excess_los%20%3D%200.0%0A%20%20%20%20_metric_col%20%3D%20metric_select.value%0A%0A%20%20%20%20for%20_p%20in%20selected_groups%3A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20_sub_df%20%3D%20active_diag%5Bactive_diag%5B%22group%22%5D%20%3D%3D%20_p%5D%0A%20%20%20%20%20%20%20%20if%20not%20_sub_df.empty%3A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20_baseline_match%20%3D%20diags.loc%5Bdiags%5B%22profile%22%5D%20%3D%3D%20_p%2C%20_metric_col%5D%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20if%20not%20_baseline_match.empty%3A%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20_baseline_val%20%3D%20_baseline_match.values%5B0%5D%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20excess_los%20%2B%3D%20_sub_df.shape%5B0%5D%20*%20_baseline_val%0A%0A%20%20%20%20admits_pct%20%3D%20(num_admits%20%2F%20total_admits%20*%20100.0)%20if%20total_admits%20%3E%200%20else%200.0%0A%20%20%20%20total_group_los%20%3D%20active_diag%5B%22spell_los%22%5D.sum()%0A%20%20%20%20beds_occupied_year%20%3D%20total_group_los%20%2F%20365.0%0A%0A%20%20%20%20rate%20%3D%20success_rate.value%20%2F%20100.0%0A%20%20%20%20savings_bed_days%20%3D%20excess_los%20*%20rate%0A%20%20%20%20beds_freed_year%20%3D%20savings_bed_days%20%2F%20365.0%0A%0A%20%20%20%20pct_saved_group%20%3D%20(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20(savings_bed_days%20%2F%20total_group_los%20*%20100.0)%20if%20total_group_los%20%3E%200%20else%200.0%0A%20%20%20%20)%0A%20%20%20%20total_test_cohort_los%20%3D%20clean_test%5B%22spell_los%22%5D.sum()%0A%20%20%20%20pct_saved_total%20%3D%20(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20(savings_bed_days%20%2F%20total_test_cohort_los%20*%20100.0)%0A%20%20%20%20%20%20%20%20if%20total_test_cohort_los%20%3E%200%0A%20%20%20%20%20%20%20%20else%200.0%0A%20%20%20%20)%0A%0A%20%20%20%20_style_base%20%3D%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%22padding%22%3A%20%2214px%2012px%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%22border-radius%22%3A%20%2210px%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%22text-align%22%3A%20%22center%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%22flex%22%3A%20%221%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%22min-width%22%3A%20%22190px%22%2C%0A%20%20%20%20%7D%0A%0A%20%20%20%20%23%201.%20Total%20Group%20Bed-Days%20%26%20Beds%20Occupied%0A%20%20%20%20card_total_group%20%3D%20mo.md(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20f%22%22%22%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%23%23%23%20%F0%9F%93%81%20**%7Btotal_group_los%3A%2C.0f%7D**%0A%20%20%20%20%20%20%20%20**Total%20%7Bgroup_label%7D%20Bed-Days**%20%20%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%3Cspan%20style%3D%22font-size%3A%2013px%3B%20font-weight%3A%20600%3B%20color%3A%20%23475569%3B%22%3E(~%7Bbeds_occupied_year%3A.0f%7D%20beds%20occupied%20%2F%20year)%3C%2Fspan%3E%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%22%22%22%0A%20%20%20%20).style(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20style%3D%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20**_style_base%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22border%22%3A%20%222px%20solid%20%238c8c8c%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22background-color%22%3A%20%22%23fafafa%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22color%22%3A%20%22%231a1a1a%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20)%0A%0A%20%20%20%20%23%202.%20Bed-Days%20Saved%20%26%20Beds%20Freed%0A%20%20%20%20card_savings%20%3D%20mo.md(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20f%22%22%22%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%23%23%23%20%F0%9F%9B%8F%EF%B8%8F%20**%7Bsavings_bed_days%3A%2C.0f%7D**%20%3Cspan%20style%3D%22font-size%3A%2015px%3B%20font-weight%3A%20600%3B%20opacity%3A%200.9%3B%22%3E(%7Bpct_saved_group%3A.0f%7D%25)%3C%2Fspan%3E%0A%20%20%20%20%20%20%20%20**Bed-Days%20Saved**%20%20%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%3Cspan%20style%3D%22font-size%3A%2013px%3B%20font-weight%3A%20600%3B%20color%3A%20%230369a1%3B%22%3E(~%7Bbeds_freed_year%3A.0f%7D%20beds%20freed%20%2F%20year)%3C%2Fspan%3E%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%22%22%22%0A%20%20%20%20).style(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20style%3D%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20**_style_base%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22border%22%3A%20%222px%20solid%20%23007bc0%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22background-color%22%3A%20%22%23f4f9fc%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22color%22%3A%20%22%23004d7a%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20)%0A%0A%20%20%20%20%23%203.%20Whole%20Hospital%20Relief%0A%20%20%20%20card_total%20%3D%20mo.md(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20f%22%22%22%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%23%23%23%20%F0%9F%93%88%20**%7Bpct_saved_total%3A.0f%7D%25**%0A%20%20%20%20%20%20%20%20**Saved%20(Entire%20Hospital%20Capacity)**%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%22%22%22%0A%20%20%20%20).style(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20style%3D%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20**_style_base%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22border%22%3A%20%222px%20solid%20%2316a34a%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22background-color%22%3A%20%22%23f0fdf4%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22color%22%3A%20%22%2314532d%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20)%0A%0A%20%20%20%20%23%20Natural%20English%20phrasing%20for%20the%20header%0A%20%20%20%20card_admits%20%3D%20mo.md(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20f%22%22%22%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%23%23%23%20%F0%9F%8F%A5%20**Patients%20Affected%3A%20%7Bnum_admits%3A%2C%7D%20Hospital%20Stays**%20(%7Bbanner_context%7D)%0A%20%20%20%20%20%20%20%20**Accounts%20for%20%7Badmits_pct%3A.0f%7D%25%20of%20all%20admissions%20over%20the%20year%20(out%20of%20%7Btotal_admits%3A%2C%7D%20total)**%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%22%22%22%0A%20%20%20%20).style(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20style%3D%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20**_style_base%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22border%22%3A%20%222px%20solid%20%236366f1%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22background-color%22%3A%20%22%23f5f3ff%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22color%22%3A%20%22%234338ca%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22flex%22%3A%20%221%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20)%0A%0A%20%20%20%20dashboard_header%20%3D%20mo.md(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20f%22%23%23%23%23%20%F0%9F%94%8D%20Counterfactual%20Scenario%20Results%20for%20**%7Bgroup_label%7D**%22%0A%20%20%20%20)%0A%0A%20%20%20%20dashboard_row%20%3D%20mo.hstack(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%5Bcard_total_group%2C%20card_savings%2C%20card_total%5D%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20justify%3D%22space-between%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20align%3D%22stretch%22%2C%0A%20%20%20%20%20%20%20%20gap%3D1.2%2C%0A%20%20%20%20)%0A%0A%20%20%20%20mo.vstack(%5Bdashboard_header%2C%20card_admits%2C%20dashboard_row%5D)%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell%0Adef%20_(outline)%3A%0A%20%20%20%20outline(4)%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell%0Adef%20_(fragment_md)%3A%0A%20%20%20%20fragment_md(%22%22%22%0A%0A%20%20%20%20%23%23%20Next%20Steps%0A%0A%20%20%20%20-%20**Co-Designing%20Discharge%20Protocols%20%26%20Teams**%3A%20Collaborating%20directly%20with%20CVUHB%20clinicians%20and%20managers%20to%20determine%20how%20specialized%20discharge%20teams%20should%20be%20structured%20and%20to%20establish%20tailored%20protocols%20targeting%20delay-inducing%20diagnoses%20identified%20by%20our%20causal%20model.%0A%0A%20%20%20%20-%20**Interactive%20Decision-Support%20Tool%3A**%20Designing%20and%20deploying%20an%20interactive%20web%20application%20for%20clinicians%20and%20operational%20managers%20to%20prioritize%20high-impact%20diagnoses%2C%20and%20measure%20the%20real-time%20bed%20capacity%20impact%20of%20tailored%20discharge%20protocols.%0A%0A%20%20%20%20-%20**Ward-Level%20Pilot%20Implementation%3A**%20Running%20a%20prospective%20pilot%20study%20within%20priority%20acute%20wards%20to%20test%20whether%20early%20diagnostic%20clarification%20and%20proactive%20multidisciplinary%20reviews%20translate%20into%20measured%20reductions%20in%20Length%20of%20Stay.%0A%0A%20%20%20%20-%20**Academic%20%26%20Practitioner%20Dissemination%3A**%20Presenting%20findings%20at%20leading%20Operations%20Research%20conferences%20(e.g.%2C%20EJOR%2C%20POMS%2C%20INFORMS)%20and%20NHS%20executive%20seminars%20to%20gather%20peer%20feedback%20and%20evaluate%20whether%20the%20framework%20generalizes%20across%20other%20NHS%20trusts%20and%20hospital%20settings.%0A%0A%20%20%20%20%22%22%22%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20)%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell%0Adef%20_()%3A%0A%20%20%20%20%23%20_selected_group%20%3D%20%22unknown%22%0A%20%20%20%20%23%20_active_diag%20%3D%20clean_test%5Bclean_test%5B%22group%22%5D%20%3D%3D%20_selected_group%5D%0A%20%20%20%20%23%20baseline_tst%20%3D%20diags.loc%5Bdiags%5B%22profile%22%5D%20%3D%3D%20_selected_group%2C%20%22ci_low%22%5D.values%5B0%5D%0A%20%20%20%20%23%20excess_tst%20%3D%20(active_diag%5B%22spell_los%22%5D%20-%20baseline_tst)%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell%0Adef%20_()%3A%0A%20%20%20%20%23%20unkn%20%3D%20clean_test%5Bclean_test%5B%22group%22%5D%20%3D%3D%20'unknown'%5D.groupby(%22PATIENT_SPECIALTY%22)%5B%22ADMIT_NUMBER%22%5D.nunique().sort_values(ascending%3DFalse)%0A%20%20%20%20%23%20knw%20%3D%20clean_test%5Bclean_test%5B%22group%22%5D%20!%3D%20'unknown'%5D.groupby(%22PATIENT_SPECIALTY%22)%5B%22ADMIT_NUMBER%22%5D.nunique().sort_values(ascending%3DFalse)%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell%0Adef%20_()%3A%0A%20%20%20%20%23%20mo.accordion(%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%7B%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22%F0%9F%94%B9%20Fragment%201%3A%20Problem%20Statement%22%3A%20mo.md(%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22Length%20of%20stay%20varies%20significantly%20across%20hospital%20departments.%22%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20)%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22%F0%9F%94%B9%20Fragment%202%3A%20Proposed%20Solution%22%3A%20mo.md(%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22Apply%20Healthcare%20Resource%20Groups%20(HRGs)%20for%20dimensionality%20reduction.%22%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20)%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22%F0%9F%94%B9%20Fragment%203%3A%20Expected%20Outcome%22%3A%20mo.md(%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%22Better%20causal%20estimates%20and%20attributable%20bed-day%20reductions.%22%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20)%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%23%20)%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell%0Adef%20_()%3A%0A%20%20%20%20%23%20import%20plotly.express%20as%20px%0A%0A%20%20%20%20%23%20%23%20Sample%20dataset%0A%20%20%20%20%23%20df%20%3D%20px.data.gapminder()%0A%0A%20%20%20%20%23%20%23%20Plotly%20animation%20frame%0A%20%20%20%20%23%20fig%20%3D%20px.scatter(%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20df%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20x%3D%22gdpPercap%22%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20y%3D%22lifeExp%22%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20animation_frame%3D%22year%22%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20animation_group%3D%22country%22%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20size%3D%22pop%22%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20color%3D%22continent%22%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20hover_name%3D%22country%22%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20log_x%3DTrue%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20size_max%3D55%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20range_x%3D%5B100%2C%20100000%5D%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20range_y%3D%5B25%2C%2090%5D%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20title%3D%22Life%20Expectancy%20vs%20GDP%20Over%20Time%22%0A%20%20%20%20%23%20)%0A%0A%20%20%20%20%23%20fig.layout.updatemenus%5B0%5D.buttons%5B0%5D.args%5B1%5D%5B%22frame%22%5D%5B%22duration%22%5D%20%3D%20500%0A%0A%20%20%20%20%23%20mo.ui.plotly(fig)%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell%0Adef%20_()%3A%0A%20%20%20%20%23%20import%20matplotlib.pyplot%20as%20plt%0A%20%20%20%20%23%20def%20generate_plot()%3A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%23%20Load%20data%20from%20local%20poster%20tables%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20caus_df%20%3D%20diags.copy()%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20diag_order%20%3D%20order_df.copy()%0A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20df%20%3D%20pd.merge(caus_df%2C%20diag_order%2C%20on%3D'profile'%2C%20how%3D'left')%0A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%23%20Clinically%20intuitive%20mapping%20grounded%20in%20ICD_HRG_mapping.csv%20descriptions%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20clinical_names%20%3D%20%7B%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'HE11'%3A%20'Hip%20%26%20Femur%20Fractures%20(HE11)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'HE'%3A%20'Musculoskeletal%20Trauma%20(HE)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'DZ11'%3A%20'Severe%20Pneumonia%20%26%20Lung%20Infection%20(DZ11)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'EB10'%3A%20'Heart%20Attack%20%26%20Cardiac%20Shock%20(EB10)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'WJ'%3A%20'Sepsis%20%26%20Severe%20Systemic%20Infection%20(WJ)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'HC'%3A%20'Spinal%20%26%20Joint%20Disorders%20(HC)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'AA'%3A%20'Stroke%20%26%20Acute%20Neurological%20(AA)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'unknown'%3A%20'%E2%98%85%20Diagnostic%20Ambiguity%20(Uncoded%20Stay)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'HD'%3A%20'Bone%20%26%20Soft-Tissue%20Musculoskeletal%20(HD)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'FD11'%3A%20'Digestive%20%26%20Oesophageal%20Cancers%20(FD11)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'AA26'%3A%20'Cerebrovascular%20%26%20Nerve%20Disorders%20(AA26)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'LA04'%3A%20'Severe%20Kidney%20Infection%20%2F%20Pyelonephritis%20(LA04)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'YQ50'%3A%20'Arterial%20Thrombosis%20%26%20Vascular%20Disease%20(YQ50)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'EB14'%3A%20'Cardiomyopathy%20%26%20Heart%20Disease%20(EB14)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'EB'%3A%20'Valvular%20%26%20Inflammatory%20Heart%20Disease%20(EB)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'DZ'%3A%20'Chronic%20Respiratory%20Conditions%20(DZ)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'KC'%3A%20'Metabolic%20%26%20Electrolyte%20Disorders%20(KC)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'LA'%3A%20'Kidney%20%26%20Urinary%20Conditions%20(LA)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'EB07'%3A%20'Cardiac%20Arrhythmias%20%26%20Conduction%20(EB07)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'JD07'%3A%20'Skin%20%26%20Subcutaneous%20Conditions%20(JD07)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'GC17'%3A%20'Liver%20%26%20Pancreatic%20Conditions%20(GC17)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'WH'%3A%20'General%20Clinical%20Surveillance%20(WH)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'LB38'%3A%20'Urinary%20Symptoms%20%26%20Haematuria%20(LB38)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'MB'%3A%20'Gynaecological%20Conditions%20(MB)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'CB'%3A%20'Oral%20%26%20Upper%20Respiratory%20(CB)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'FD'%3A%20'Gastrointestinal%20Infections%20(FD)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'LB'%3A%20'Bladder%20%26%20Kidney%20Disorders%20(LB)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'FD10'%3A%20'General%20Intestinal%20Disorders%20(FD10)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'FD02'%3A%20'Inflammatory%20Bowel%20Disease%20(FD02)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'DZ65'%3A%20'Chronic%20Bronchitis%20%26%20COPD%20(DZ65)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'FD03'%3A%20'Peptic%20Ulcer%20%26%20GI%20Bleeding%20(FD03)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'SA04'%3A%20'Iron%20Deficiency%20Anaemia%20(SA04)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'DZ19'%3A%20'Wheezing%20%26%20Bronchospasm%20(DZ19)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'EB12'%3A%20'Non-cardiac%20Chest%20Pain%20(EB12)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'FD05'%3A%20'Non-specific%20Abdominal%20Pain%20(FD05)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20'WH52'%3A%20'Post-Surgical%20Cancer%20Surveillance%20(WH52)'%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%7D%0A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20df%5B'clinical_name'%5D%20%3D%20df%5B'profile'%5D.map(clinical_names).fillna(df%5B'profile'%5D)%0A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%23%20Sort%20by%20ate_days%20ascending%20so%20largest%20delays%20appear%20at%20top%20of%20Y-axis%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20df%20%3D%20df.sort_values(by%3D'ate_days'%2C%20ascending%3DTrue).reset_index(drop%3DTrue)%0A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%23%20Color%20definitions%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20colors%20%3D%20%5B%5D%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20for%20idx%2C%20row%20in%20df.iterrows()%3A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20if%20row%5B'profile'%5D%20%3D%3D%20'unknown'%3A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20colors.append('%23dc2626')%20%23%20Vivid%20crimson%20for%20unknown%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20elif%20row%5B'ci_low'%5D%20%3E%200%3A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20colors.append('%23e05638')%20%23%20Coral%20red%20for%20statistically%20significant%20positive%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20elif%20row%5B'ci_high'%5D%20%3C%200%3A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20colors.append('%230d9488')%20%23%20Teal%20for%20statistically%20significant%20negative%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20else%3A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20colors.append('%2394a3b8')%20%23%20Slate%20gray%20for%20not%20significant%0A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%23%20Bubble%20sizing%20proportional%20to%20admission%20volume%20in%20NHS%20cohort%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20prop_pct%20%3D%20df%5B'proportion'%5D%20*%20100%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20sizes%20%3D%2075%20%2B%20(prop_pct%20%2F%20prop_pct.max())%20*%20520%0A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%23%20Layout%20dimensions%20optimized%20for%20A0%20poster%20card%20width%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20fig%2C%20ax%20%3D%20plt.subplots(figsize%3D(11.5%2C%2014.5)%2C%20dpi%3D300)%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20fig.patch.set_facecolor('%23ffffff')%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20ax.set_facecolor('%23f8fafc')%0A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20y_pos%20%3D%20np.arange(len(df))%0A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%23%20Subtle%20background%20gridlines%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20for%20y%20in%20y_pos%3A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20ax.axhline(y%2C%20color%3D'%23e2e8f0'%2C%20linestyle%3D'-'%2C%20linewidth%3D0.9%2C%20zorder%3D1)%0A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%23%20Solid%20vertical%20zero%20line%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20ax.axvline(0%2C%20color%3D'%23475569'%2C%20linestyle%3D'-'%2C%20linewidth%3D2.2%2C%20zorder%3D2)%0A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%23%2095%25%20Confidence%20Interval%20error%20bars%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20xerr_low%20%3D%20df%5B'ate_days'%5D%20-%20df%5B'ci_low'%5D%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20xerr_high%20%3D%20df%5B'ci_high'%5D%20-%20df%5B'ate_days'%5D%0A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20ax.errorbar(%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20df%5B'ate_days'%5D%2C%20y_pos%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20xerr%3D%5Bxerr_low%2C%20xerr_high%5D%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20fmt%3D'none'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20ecolor%3D'%23334155'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20elinewidth%3D2.0%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20capsize%3D4.5%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20capthick%3D1.8%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20zorder%3D3%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20)%0A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%23%20Scatter%20points%20(bubbles)%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20ax.scatter(%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20df%5B'ate_days'%5D%2C%20y_pos%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20s%3Dsizes%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20c%3Dcolors%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20edgecolors%3D'%230f172a'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20linewidth%3D1.4%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20alpha%3D0.94%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20zorder%3D4%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20)%0A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%23%20Soft%20red%20highlight%20band%20behind%20the%20Unknown%2FUncoded%20diagnosis%20row%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20unknown_idx%20%3D%20df%5Bdf%5B'profile'%5D%20%3D%3D%20'unknown'%5D.index%5B0%5D%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20ax.axhspan(unknown_idx%20-%200.48%2C%20unknown_idx%20%2B%200.48%2C%20color%3D'%23fee2e2'%2C%20alpha%3D0.65%2C%20zorder%3D0)%0A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%23%20Y-axis%20labels%20with%20increased%20font%20size%20for%20poster%20readability%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20ax.set_yticks(y_pos)%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20labels%20%3D%20df%5B'clinical_name'%5D.tolist()%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20ax.set_yticklabels(labels%2C%20fontsize%3D12.2%2C%20fontweight%3D'medium'%2C%20color%3D'%230f172a')%0A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%23%20Distinctive%20styling%20for%20Unknown%20Diagnosis%20label%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20ax.get_yticklabels()%5Bunknown_idx%5D.set_fontweight('bold')%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20ax.get_yticklabels()%5Bunknown_idx%5D.set_color('%23b91c1c')%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20ax.get_yticklabels()%5Bunknown_idx%5D.set_fontsize(13.2)%0A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%23%20X-axis%20configuration%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20ax.set_xlim(-8.5%2C%2016.8)%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20ax.set_xlabel('Causal%20Effect%20on%20Hospital%20Stay%20(Average%20Treatment%20Effect%2C%20Days)'%2C%20fontsize%3D14.0%2C%20fontweight%3D'bold'%2C%20color%3D'%230a2540'%2C%20labelpad%3D12)%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20ax.tick_params(axis%3D'x'%2C%20labelsize%3D12.5%2C%20colors%3D'%231e293b')%0A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%23%20Direction%20indicators%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20ax.annotate('%E2%86%90%20Shorter%20Hospital%20Stay'%2C%20xy%3D(-4.5%2C%20len(df)-0.1)%2C%20xytext%3D(-4.5%2C%20len(df)%2B0.75)%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20ha%3D'center'%2C%20fontsize%3D12.5%2C%20fontweight%3D'bold'%2C%20color%3D'%230d9488'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20annotation_clip%3DFalse)%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20ax.annotate('Extends%20Hospital%20Stay%20(Days)%20%E2%86%92'%2C%20xy%3D(8.0%2C%20len(df)-0.1)%2C%20xytext%3D(8.0%2C%20len(df)%2B0.75)%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20ha%3D'center'%2C%20fontsize%3D12.5%2C%20fontweight%3D'bold'%2C%20color%3D'%23e05638'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20annotation_clip%3DFalse)%0A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%23%20Header%20Title%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20ax.set_title('Causal%20Effect%20of%20Diagnoses%20on%20Inpatient%20Length%20of%20Stay%20(LoS)'%2C%20fontsize%3D16.0%2C%20fontweight%3D'bold'%2C%20color%3D'%230a2540'%2C%20pad%3D28)%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20ax.text(0.5%2C%201.018%2C%20'Bubble%20size%20%3D%20Volume%20(%25%20of%20NHS%20admissions)%20%7C%20Error%20bars%20%3D%2095%25%20Confidence%20Interval%20(DML-IRM)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20transform%3Dax.transAxes%2C%20ha%3D'center'%2C%20fontsize%3D11.5%2C%20color%3D'%23475569'%2C%20style%3D'italic')%0A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%23%20Informative%20callout%20for%20Diagnostic%20Ambiguity%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20ax.annotate('Diagnostic%20Ambiguity%3A%5Cn%2B2.53%20days%20causal%20delay%5Cn(28.0%25%20of%20all%20admissions)'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20xy%3D(df.loc%5Bunknown_idx%2C%20'ate_days'%5D%2C%20unknown_idx)%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20xytext%3D(df.loc%5Bunknown_idx%2C%20'ate_days'%5D%20%2B%204.2%2C%20unknown_idx%20-%203.8)%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20fontsize%3D11.0%2C%20fontweight%3D'bold'%2C%20color%3D'%23b91c1c'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20arrowprops%3Ddict(arrowstyle%3D'-%3E'%2C%20color%3D'%23b91c1c'%2C%20lw%3D1.8%2C%20connectionstyle%3D'arc3%2Crad%3D-0.2')%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20bbox%3Ddict(boxstyle%3D'round%2Cpad%3D0.55'%2C%20facecolor%3D'%23ffffff'%2C%20edgecolor%3D'%23ef4444'%2C%20lw%3D1.5)%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20zorder%3D5)%0A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%23%20Informative%20callout%20for%20HE11%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20he11_idx%20%3D%20df%5Bdf%5B'profile'%5D%20%3D%3D%20'HE11'%5D.index%5B0%5D%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20ax.annotate('Hip%2FFemur%20Fractures%3A%5Cn%2B14.09%20days%20delay'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20xy%3D(df.loc%5Bhe11_idx%2C%20'ate_days'%5D%2C%20he11_idx)%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20xytext%3D(df.loc%5Bhe11_idx%2C%20'ate_days'%5D%20-%206.2%2C%20he11_idx%20-%201.8)%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20fontsize%3D10.5%2C%20fontweight%3D'bold'%2C%20color%3D'%23e05638'%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20arrowprops%3Ddict(arrowstyle%3D'-%3E'%2C%20color%3D'%23e05638'%2C%20lw%3D1.5%2C%20connectionstyle%3D'arc3%2Crad%3D0.15')%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20bbox%3Ddict(boxstyle%3D'round%2Cpad%3D0.45'%2C%20facecolor%3D'%23ffffff'%2C%20edgecolor%3D'%23e05638'%2C%20lw%3D1.2)%2C%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20zorder%3D5)%0A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%23%20Frame%20lines%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20for%20spine%20in%20%5B'top'%2C%20'right'%5D%3A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%20%20%20%20ax.spines%5Bspine%5D.set_visible(False)%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20ax.spines%5B'left'%5D.set_color('%2394a3b8')%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20ax.spines%5B'left'%5D.set_linewidth(1.2)%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20ax.spines%5B'bottom'%5D.set_color('%2394a3b8')%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20ax.spines%5B'bottom'%5D.set_linewidth(1.2)%0A%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20plt.tight_layout()%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20plt.show()%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%23%20fig.savefig(output_path_png%2C%20dpi%3D300%2C%20bbox_inches%3D'tight')%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%23%20fig.savefig(output_path_pdf%2C%20bbox_inches%3D'tight')%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%23%20plt.close(fig)%0A%20%20%20%20%23%20%20%20%20%20%23%20print(f'Successfully%20generated%3A%20%7Boutput_path_png%7D')%0A%20%20%20%20%23%20generate_plot()%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0A%40app.cell(hide_code%3DTrue)%0Adef%20_(mo)%3A%0A%20%20%20%20_src%20%3D%20%22https%3A%2F%2Fraw.githubusercontent.com%2FmustafaslanCoto%2FmustafaslanCoto.github.io%2Fmain%2Ftalks%2Fimages%2Ffollow_us.png%22%0A%0A%20%20%20%20_text%20%3D%20mo.md(%22%23%20Any%20questions%20or%20thoughts%3F%20%F0%9F%92%AC%22)%0A%20%20%20%20%23%20_text%20%3D%20mo.vstack(%5B_thanks%5D%2C%20align%3D%22center%22)%0A%20%20%20%20_image%20%3D%20mo.Html(%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'%3Cdiv%20style%3D%22container-type%3Ainline-size%3Bwidth%3A100%25%22%3E'%0A%20%20%20%20%20%20%20%20f'%3Cimg%20src%3D%22%7B_src%7D%22%20style%3D%22display%3Ablock%3Bmargin%3A0%20auto%3Bmax-height%3A55vh%3Bmax-width%3A100%25%22%3E'%0A%20%20%20%20%20%20%20%20'%3C%2Fdiv%3E'%0A%20%20%20%20)%0A%0A%20%20%20%20mo.vstack(%5B_text%2C%20_image%5D%2C%20align%20%3D%20%22center%22)%0A%20%20%20%20return%0A%0A%0Aif%20__name__%20%3D%3D%20%22__main__%22%3A%0A%20%20%20%20app.run()%0A